Конфокальная микроскопия (от латинского con — "вместе" и" фокус") — один из методов «обычной», оптической микроскопии. В отличие от обыкновенного микроскопа, конфокальный микроскоп решает проблему внефокусных лучей (идущих из глубины образца), которые снижают контраст в обычном световом микроскопе. За счёт специальной диафрагмы, которая расположена в плоскости промежуточного изображения, конфокальный микроскоп может пропускать только те световые лучи, которые идут от плоскости фокуса, при этом с небольшой площади. Полное изображение в конфокальном микроскопе строится при последовательном сканировании небольших частей объекта.
Накопление информации происходит при помощи специальных фотоприемников, а в качестве источников света, освещающих образец широко используются лазеры, обладающие высокой интенсивностью и монохроматичностью (одной длиной волны) излучения. В результате контрастность полученных изображений гораздо выше, чем в случае оптической микроскопии. Для управления всей системой, формирования и хранения изображений, обработки результатов применяются компьютеры. Поэтому сейчас такие приборы часто называют лазерными сканирующими конфокальными микроскопами.